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細(xì)胞STR鑒定檢測

作者:小編 更新時間:2023-08-03 點(diǎn)擊數(shù):

STR即短串聯(lián)重復(fù)序列(Short Tandem Repeats),也稱微衛(wèi)星DNA(microsatellite DNA),是一段包含1-6bp的重復(fù)DNA序列。STR廣泛存在于原核動物和真核動物中,人類中也不例外,約占人類基因組的3%。由于其多態(tài)性和高突變率,STR在生物學(xué)研究中得到了廣泛的應(yīng)用,又被稱為細(xì)胞的DNA指紋。咨詢電話:13816144967(微信同號)

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由于STR技術(shù)的高靈敏度、自動化程度高、準(zhǔn)確快速、重復(fù)性好等優(yōu)點(diǎn),STR基因分型已被作為金標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)用于細(xì)胞鑒定,由于細(xì)胞系交叉污染或錯誤辨識而導(dǎo)致研究錯誤、結(jié)果不可重復(fù)等情況的存在,因此建議在實驗開展前進(jìn)行細(xì)胞的STR鑒定分析。

細(xì)胞STR鑒定即通過STR信息建立細(xì)胞系的遺傳特性,通過STR鑒定來檢測細(xì)胞是否發(fā)生交叉污染或者誤認(rèn)的情況。STR 基因座位上的等位基因可通過擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細(xì)管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。隨后通過一定的計算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫比對,從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。

STR基因位點(diǎn)由長度為3~7個堿基對的短串連重復(fù)序列組成,這些重復(fù)序列廣泛存在于人類基因組中,可作為高度多態(tài)性標(biāo)記,被稱為細(xì)胞的DNA指紋。 STR基因座位上的等位基因可通過PCR擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細(xì)管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別,隨后通過一定的計算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與專業(yè)的細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫比對從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。 STR的鑒定結(jié)果能證明以下問題: 1. 是否為人源細(xì)胞;2. 是否為標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞系;3. 是否存在物種內(nèi)交叉污染。據(jù)統(tǒng)計,約18%~30%細(xì)胞系被交叉污染或錯誤辨識,使用該細(xì)胞可能導(dǎo)致研究結(jié)論錯誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細(xì)胞治療災(zāi)難性后果等。 2009年起,NIH和ATCC呼吁研究者對細(xì)胞進(jìn)行STR鑒定并著手建立細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫。如今,細(xì)胞STR鑒定已是鑒別細(xì)胞身份及交叉污染的金標(biāo)準(zhǔn)。多數(shù)權(quán)威期刊也要求作者投稿時提供細(xì)胞STR鑒定證明?!吨袊幍洹分忻鞔_規(guī)定,新建細(xì)胞系/株、細(xì)胞庫和生產(chǎn)終末細(xì)胞應(yīng)進(jìn)行鑒別試驗,以確認(rèn)為本細(xì)胞,且無其他細(xì)胞的交叉污染。

什么時候需細(xì)胞STR鑒定?

? 當(dāng)實驗室引入新的細(xì)胞系

? 細(xì)胞來源于組織 – 原代細(xì)胞

? 文章發(fā)表,國外期刊雜志要求

? 細(xì)胞功能不正常

? 細(xì)胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大

? 細(xì)胞已連續(xù)培養(yǎng)2個月時,實驗室細(xì)胞常規(guī)定期鑒定

? 當(dāng)實驗室使用超過一種細(xì)胞系時,所有細(xì)胞系最好先鑒定以排除交叉污染的可能 

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